通路富集 · 示例与输入说明
下载示例 CSV多组富集气泡图
Enrichment dots · 在多队列之间比较通路比例、特征数与 FDR。
如何读这张图
- 每个点对应一个队列中的一条通路，横轴为 GeneRatio，纵轴为通路名称。
- 点的面积表示 Count，颜色表示 FDR；图例给出映射关系。队列分面便于横向比较。
准备自己的数据
- GeneRatio 使用 0–1 范围的小数，不要输入百分数字符串。
- Count 是命中特征数，FDR 是多重检验校正后的值；比较队列时需确认使用一致的背景集和分析方法。
输入字段
保留 CSV 表头，每行一条观测。以下字段均包含在示例中。
| 字段 | 类型 | 含义与要求 |
|---|---|---|
Cohort | 文本 | 队列或比较分组。 |
Term | 文本 | 通路或功能条目名称。 |
GeneRatio | 数值 | 命中特征占输入特征的比例，0 ≤ 值 ≤ 1。 |
Count | 整数 | 命中特征数，正整数。 |
FDR | 数值 | 多重检验校正后的值，0 ≤ 值 ≤ 1。 |
QuerySize | 整数 | 输入特征总数，本例 GeneRatio = Count / QuerySize。 |
PValue | 数值 | 模拟原始 P 值；本例按每队列的 5 条通路进行 BH 校正得到 FDR。 |
Ontology | 文本 | 示例保留的通路分类信息。 |
下载示例、对照字段，在自己的本地绘图环境中使用。网站提供图型浏览、模板与组件交流。